16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_8282 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_8282  predicted protein  100 
 
 
92 aa  187  5.999999999999999e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50240  predicted protein  46.94 
 
 
295 aa  54.7  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45662  predicted protein  41.94 
 
 
291 aa  52.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.961827  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48554  DNA-binding transcription factor  39.58 
 
 
356 aa  52  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.911244  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49938  predicted protein  41.82 
 
 
326 aa  49.3  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.721311  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42576  predicted protein  42.11 
 
 
461 aa  48.5  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.536498  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50336  predicted protein  41.67 
 
 
342 aa  47.8  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38097  predicted protein  40.68 
 
 
429 aa  47.4  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45968  predicted protein  31.11 
 
 
304 aa  47  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39045  predicted protein  37.5 
 
 
368 aa  46.2  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45664  predicted protein  39.34 
 
 
287 aa  45.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49937  predicted protein  40.82 
 
 
428 aa  43.9  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02885  Non-histone chromosomal protein 6 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B995]  35.14 
 
 
106 aa  43.9  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00549573  normal  0.269501 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34626  predicted protein  31.82 
 
 
287 aa  43.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000000196337  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39880  predicted protein  31.82 
 
 
287 aa  43.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44432  predicted protein  34.48 
 
 
659 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.614859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>