13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44338 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_44338  predicted protein  100 
 
 
350 aa  732    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.406283  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33757  predicted protein  49.84 
 
 
324 aa  314  1.9999999999999998e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44339  predicted protein  44.67 
 
 
580 aa  306  3e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18161  predicted protein  30.04 
 
 
255 aa  90.1  5e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0058077  normal  0.125778 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1572  hypothetical protein  32.06 
 
 
320 aa  69.7  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.89926e-16 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2860  hypothetical protein  25.96 
 
 
214 aa  55.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07562  alpha-1,6-mannosyltransferase subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14910)  23.83 
 
 
461 aa  53.5  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.188421 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31150  galactosyltransferase  23.76 
 
 
364 aa  52.4  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.243334  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3133  hypothetical protein  28.68 
 
 
461 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542527  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5234  hypothetical protein  28.68 
 
 
461 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.978819  normal  0.461326 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0430  hypothetical protein  28.24 
 
 
440 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5038  hypothetical protein  28.68 
 
 
439 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10041  conserved hypothetical protein  31.25 
 
 
320 aa  46.2  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.715776 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>