48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42428 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42428  predicted protein  100 
 
 		 252 aa  511  1e-144  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0235  hypothetical protein  33.75 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000105707  hitchhiker  0.0000000000000116702 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1593  hypothetical protein  35.9 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3786  RNA binding S1  35.9 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.198165  normal  0.0264698 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16900  RNA binding protein, S1 family  32.26 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2136  RNA binding S1 domain protein  32.12 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000118125  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2903  RNA binding S1 domain protein  34.48 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.144767  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2031  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.46 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2473  RNA binding S1 domain protein  32.99 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.728532 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1111  hypothetical protein  41.67 
 
 		 298 aa  57  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3187  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.547241  normal  0.0826379 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4253  hypothetical protein  37.07 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1446  RNA binding S1  35.34 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49930  hypothetical protein  36.21 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.358542 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1514  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.95 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3864  RNA-binding S1 domain-containing protein  35.51 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2080  RNA binding S1 domain protein  30.91 
 
 		 274 aa  53.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.56309e-28 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1813  hypothetical protein  34.04 
 
 		 277 aa  52.8  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0500461  normal  0.539487 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003424  hypothetical protein  34.41 
 
 		 277 aa  52.4  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.303245  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1727  yitL protein  27.67 
 
 		 287 aa  52.4  0.000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1518  hypothetical protein  34.95 
 
 		 280 aa  52  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0135842 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11108  hypothetical protein  35.79 
 
 		 276 aa  51.6  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.533639  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2647  hypothetical protein  31.96 
 
 		 274 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.902029  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1452  RNA-binding S1 domain-containing protein  32.98 
 
 		 277 aa  51.6  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4563  RNA binding S1 domain protein  34.29 
 
 		 278 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1326  RNA-binding S1 domain-containing protein  35.24 
 
 		 278 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0886  RNA binding S1 domain protein  34.69 
 
 		 274 aa  50.4  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000369657  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02354  hypothetical protein  34.41 
 
 		 277 aa  50.1  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1187  hypothetical protein  36.73 
 
 		 151 aa  50.4  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4023  hypothetical protein  29.91 
 
 		 277 aa  50.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1724  hypothetical protein  35.11 
 
 		 301 aa  50.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.437519  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1515  nucleic acid binding protein  28.83 
 
 		 276 aa  50.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0056  RNA binding S1  38.3 
 
 		 301 aa  49.7  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4071  RNA-binding S1 domain-containing protein  34.29 
 
 		 278 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01079  hypothetical protein  35.79 
 
 		 305 aa  49.3  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4487  hypothetical protein  28.31 
 
 		 284 aa  49.3  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.830856  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3240  uncharacterized protein-like protein  40.43 
 
 		 280 aa  48.9  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5129  RNA binding S1 domain protein  34.74 
 
 		 276 aa  48.9  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4021  hypothetical protein  30.32 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000280354  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1966  hypothetical protein  34.12 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.294395  normal  0.185697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1813  hypothetical protein  28.4 
 
 		 283 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.307669 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1481  hypothetical protein  32.67 
 
 		 300 aa  43.5  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1452  hypothetical protein  32.67 
 
 		 300 aa  43.5  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.288819  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1511  hypothetical protein  34.34 
 
 		 284 aa  43.1  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00830658  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1301  RNA-binding protein  32.98 
 
 		 287 aa  42.7  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.237432  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2281  hypothetical protein  30.77 
 
 		 277 aa  42.7  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.014395  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2783  hypothetical protein  28.87 
 
 		 284 aa  42.7  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0117976  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1645  hypothetical protein  25.62 
 
 		 280 aa  42  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>