11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_31442 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_31442  predicted protein  100 
 
 
322 aa  660    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30479  predicted protein  24.66 
 
 
240 aa  62.4  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22819  predicted protein  23.02 
 
 
185 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.134884  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8963  predicted protein  20.26 
 
 
226 aa  49.7  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.66909  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31436  predicted protein  24.77 
 
 
238 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0440287  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16632  predicted protein  23.96 
 
 
186 aa  47.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0983829  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06860  hypothetical protein  24.14 
 
 
189 aa  46.6  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16592  predicted protein  26.18 
 
 
187 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00540575  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15699  predicted protein  22.83 
 
 
228 aa  43.5  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0359355  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01247  integral membrane protein, Mpv17/PMP22 family, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10340)  22.33 
 
 
252 aa  42.7  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7358  predicted protein  26.06 
 
 
184 aa  42.7  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.61572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>