39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_24838 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_24838  type II DNA topoisomerase VI subunit  100 
 
 		 430 aa  884    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12516  predicted protein  66.27 
 
 		 339 aa  492  9.999999999999999e-139  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.343264  normal  0.74988 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0667  DNA topoisomerase VI subunit A  34.34 
 
 		 379 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0943  DNA topoisomerase VI subunit A  34.89 
 
 		 367 aa  233  7.000000000000001e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2770  DNA topoisomerase VI subunit A  33.52 
 
 		 367 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0861  DNA topoisomerase VI subunit A  34.71 
 
 		 367 aa  228  1e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0732584 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1392  DNA topoisomerase VI subunit A  34.54 
 
 		 367 aa  225  1e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1927  DNA topoisomerase VI subunit A  33.79 
 
 		 367 aa  223  6e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.856595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3023  DNA topoisomerase VI subunit A  34.08 
 
 		 367 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2839  DNA topoisomerase VI subunit A  33.52 
 
 		 367 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2928  DNA topoisomerase VI subunit A  33.8 
 
 		 367 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1552  DNA topoisomerase VI subunit A  35 
 
 		 369 aa  215  9.999999999999999e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.774461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1755  DNA topoisomerase VI subunit A  32.73 
 
 		 386 aa  207  3e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0808112  normal  0.29442 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1948  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  34.07 
 
 		 389 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.86374  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1013  DNA topoisomerase VI subunit A  31.97 
 
 		 363 aa  186  8e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0748  DNA topoisomerase VI subunit A  31.58 
 
 		 365 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0682  DNA topoisomerase VI subunit A  31.29 
 
 		 365 aa  168  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1236  DNA topoisomerase VI subunit A  30.99 
 
 		 365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1407  DNA topoisomerase VI subunit A  29.66 
 
 		 370 aa  167  4e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0141  DNA topoisomerase VI subunit A  30.99 
 
 		 365 aa  167  5e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0640  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  31.52 
 
 		 362 aa  163  5.0000000000000005e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2806  DNA topoisomerase VI subunit A  32.53 
 
 		 369 aa  160  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0158591  hitchhiker  0.00294099 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2285  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  30.42 
 
 		 364 aa  157  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2727  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  30.28 
 
 		 366 aa  151  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.608904  normal  0.699112 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1315  DNA topoisomerase VI subunit A  29.77 
 
 		 361 aa  150  5e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.88306  normal  0.176233 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1202  DNA topoisomerase VI subunit A  28.41 
 
 		 373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.125712  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0129  DNA topoisomerase VI subunit A  29.91 
 
 		 370 aa  147  3e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.437456  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0600  DNA topoisomerase VI subunit A  29.04 
 
 		 357 aa  144  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.375144  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36531  type II DNA topoisomerase VI subunit  29.19 
 
 		 432 aa  136  6.0000000000000005e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2920  DNA topoisomerase VI subunit A  27.27 
 
 		 340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0417  DNA topoisomerase VI subunit A  27.98 
 
 		 365 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0014669 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1587  DNA topoisomerase VI subunit A  27.25 
 
 		 362 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2196  DNA topoisomerase VI subunit A  28.06 
 
 		 362 aa  128  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0743  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  28.53 
 
 		 362 aa  125  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.045312  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27014  predicted protein  35.09 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0279403  normal  0.0136943 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1736  DNA topoisomerase VI subunit A  26.2 
 
 		 362 aa  124  5e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.418676  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01330  endodeoxyribonuclease, putative  32.86 
 
 		 559 aa  119  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08259  spo11 homologue spoA (Eurofung)  32.62 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.519645 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31531  predicted protein  29.65 
 
 		 414 aa  49.7  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.288827  normal  0.0593553 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>