20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0883 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0883  hypothetical protein  100 
 
 
453 aa  941    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.985622 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0581  polysaccharide deacetylase  29.7 
 
 
470 aa  154  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1371  hypothetical protein  30.84 
 
 
470 aa  130  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1559  hypothetical protein  28.08 
 
 
478 aa  96.3  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462896  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05615  hypothetical protein  25.07 
 
 
405 aa  89.4  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.776737  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1110  hypothetical protein  27.92 
 
 
347 aa  88.6  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.506924  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1140  hypothetical protein  34.69 
 
 
348 aa  87.4  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0766  hypothetical protein  26.38 
 
 
423 aa  84  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.249559 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1116  hypothetical protein  26.87 
 
 
349 aa  77.4  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0383  hypothetical protein  25.16 
 
 
342 aa  76.3  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3172  hypothetical protein  26.71 
 
 
304 aa  72  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.296474 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4421  hypothetical protein  25.94 
 
 
420 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  0.170958 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1832  hypothetical protein  25.26 
 
 
280 aa  71.2  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1128  hypothetical protein  25.79 
 
 
495 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2497  hypothetical protein  28.65 
 
 
294 aa  68.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1599  hypothetical protein  25.87 
 
 
466 aa  65.5  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1737  hypothetical protein  27.74 
 
 
469 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3968  hypothetical protein  24.67 
 
 
501 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0443888 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0814  hypothetical protein  24.71 
 
 
485 aa  61.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3424  hypothetical protein  24.73 
 
 
358 aa  54.7  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>