51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2335 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3429  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  60.25 
 
 		 572 aa  701    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2675  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  60.25 
 
 		 572 aa  697    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2694  TPR repeat-containing protein  63.25 
 
 		 580 aa  689    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.407623  normal  0.0520639 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2335  Tetratricopeptide domain protein  100 
 
 		 563 aa  1161    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014328 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1851  TPR repeat-containing protein  51.64 
 
 		 571 aa  554  1e-156  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0555  tetratricopeptide region  49.65 
 
 		 560 aa  547  1e-154  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.45789  normal  0.384774 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20870  Tetratricopeptide repeat (TPR) protein  50.38 
 
 		 539 aa  526  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2863  TPR repeat-containing protein  51.35 
 
 		 525 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0105182  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4467  Tetratricopeptide repeat protein  46.36 
 
 		 568 aa  488  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2869  hypothetical protein  46.91 
 
 		 568 aa  472  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.451672  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2264  hypothetical protein  45.23 
 
 		 621 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.750308  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1877  hypothetical protein  46.71 
 
 		 587 aa  468  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.220347  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1581  Tetratricopeptide domain protein  44.95 
 
 		 578 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00337533  normal  0.487012 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1969  hypothetical protein  45.23 
 
 		 581 aa  438  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1371  TPR repeat-containing protein  45.24 
 
 		 601 aa  424  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0432859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0768  TPR repeat-containing protein  41.76 
 
 		 552 aa  423  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2307  TPR repeat-containing protein  42.97 
 
 		 598 aa  360  3e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.062343 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4301  TPR repeat-containing protein  38.37 
 
 		 625 aa  339  8e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1486  TPR repeat-containing protein  39.57 
 
 		 623 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1004  TPR repeat-containing protein  38.4 
 
 		 625 aa  326  7e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3291  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.43 
 
 		 625 aa  325  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1317  TPR repeat-containing protein  39.26 
 
 		 533 aa  325  2e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.573669  normal  0.99771 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03987  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G00240)  36.72 
 
 		 580 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2796  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 563 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.489638  normal  0.742166 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2769  tetratricopeptide TPR_2  37.5 
 
 		 563 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.156917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2813  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 563 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.48594  normal  0.196641 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3331  TPR repeat-containing protein  37.32 
 
 		 565 aa  307  3e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.643296  normal  0.0437808 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3057  TPR repeat-containing protein  37.96 
 
 		 559 aa  307  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297776 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0989  hypothetical protein  34.73 
 
 		 577 aa  301  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.659659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1465  TPR repeat-containing protein  36.13 
 
 		 574 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.388393  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1379  TPR repeat-containing protein  36.69 
 
 		 559 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4326  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.5 
 
 		 584 aa  295  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2608  TPR domain-containing protein  36.48 
 
 		 601 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3942  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 		 563 aa  292  9e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal  0.567153 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0381  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.84 
 
 		 559 aa  290  5.0000000000000004e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.850569  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02878  conserved hypothetical protein  35.87 
 
 		 594 aa  287  2.9999999999999996e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.291051 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1113  TPR repeat-containing protein  36.01 
 
 		 537 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0462  TPR domain-containing protein  36.01 
 
 		 537 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0186  TPR domain-containing protein  36.01 
 
 		 537 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.240778  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1219  TPR domain-containing protein  36.01 
 
 		 537 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121944  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03470  conserved expressed protein  31.35 
 
 		 576 aa  268  1e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0846142  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02657  conserved hypothetical protein  31.81 
 
 		 600 aa  255  1.0000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000025246  normal  0.0917143 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38668  predicted protein  34.5 
 
 		 626 aa  220  7e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0793283  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5657  tetratricopeptide TPR_4  28.86 
 
 		 530 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1942  tetratricopeptide TPR_4  27.99 
 
 		 530 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2242  TPR repeat-containing protein  25.34 
 
 		 541 aa  131  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433133  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3941  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.65 
 
 		 871 aa  130  6e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.817968  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3655  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 		 506 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1061  tetratricopeptide domain-containing protein  27.47 
 
 		 556 aa  107  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2073  TPR repeat-containing protein  23.78 
 
 		 532 aa  84  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2168  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.42 
 
 		 537 aa  57.8  0.0000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>