57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3130 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3130  S-adenosylmethionine decarboxylase  100 
 
 		 264 aa  549  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2837  S-adenosylmethionine decarboxylase  92.42 
 
 		 264 aa  520  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1015  S-adenosylmethionine decarboxylase  90.91 
 
 		 264 aa  511  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3355  S-adenosylmethionine decarboxylase  89.02 
 
 		 264 aa  507  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000217345  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1024  S-adenosylmethionine decarboxylase  89.02 
 
 		 264 aa  507  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3483  S-adenosylmethionine decarboxylase  89.02 
 
 		 264 aa  507  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000055229  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4002  S-adenosylmethionine decarboxylase  90.08 
 
 		 264 aa  506  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0668  S-adenosylmethionine decarboxylase  84.47 
 
 		 264 aa  481  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000040658  normal  0.405798 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3482  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  83.71 
 
 		 264 aa  481  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000023207  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0124  S-adenosylmethionine decarboxylase  83.71 
 
 		 264 aa  481  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000121988  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0122  S-adenosylmethionine decarboxylase  83.71 
 
 		 264 aa  481  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0933555  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3539  S-adenosylmethionine decarboxylase  83.71 
 
 		 264 aa  481  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0130  S-adenosylmethionine decarboxylase  83.71 
 
 		 264 aa  481  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.274606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0113  S-adenosylmethionine decarboxylase  83.71 
 
 		 264 aa  481  1e-135  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000197451  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0181  S-adenosylmethionine decarboxylase  84.85 
 
 		 264 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.515006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0189  S-adenosylmethionine decarboxylase  84.47 
 
 		 264 aa  481  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.409769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0184  S-adenosylmethionine decarboxylase  84.85 
 
 		 264 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.877989 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0197  S-adenosylmethionine decarboxylase  84.85 
 
 		 264 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.940693  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0180  S-adenosylmethionine decarboxylase  84.47 
 
 		 264 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0127  S-adenosylmethionine decarboxylase  83.71 
 
 		 264 aa  481  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00118  hypothetical protein  83.71 
 
 		 264 aa  481  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000726106  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00119  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  83.71 
 
 		 264 aa  481  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00015961  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0795  S-adenosylmethionine decarboxylase  68.08 
 
 		 264 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08390  S-adenosylmethionine decarboxylase  67.69 
 
 		 264 aa  388  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000233299 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46080  S-adenosylmethionine decarboxylase  68.46 
 
 		 264 aa  386  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5109  S-adenosylmethionine decarboxylase  66.54 
 
 		 264 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2355  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  68.34 
 
 		 269 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0598  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  67.05 
 
 		 264 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4575  S-adenosylmethionine decarboxylase  66.67 
 
 		 264 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3552  S-adenosylmethionine decarboxylase  65.64 
 
 		 263 aa  372  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2078  S-adenosylmethionine decarboxylase  68.06 
 
 		 292 aa  372  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2244  S-adenosylmethionine decarboxylase  67.05 
 
 		 273 aa  372  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.868188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2794  S-adenosylmethionine decarboxylase  66.29 
 
 		 271 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0123327  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0951  S-adenosylmethionine decarboxylase  65.4 
 
 		 276 aa  367  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3714  S-adenosylmethionine decarboxylase  65 
 
 		 264 aa  360  2e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0878  S-adenosylmethionine decarboxylase  65.52 
 
 		 264 aa  358  5e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00026083  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04007  S-adenosylmethionine decarboxylase  65 
 
 		 264 aa  357  9.999999999999999e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0791  S-adenosylmethionine decarboxylase  65.13 
 
 		 264 aa  356  1.9999999999999998e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1749  S-adenosylmethionine decarboxylase  65.5 
 
 		 279 aa  355  2.9999999999999997e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.163697  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1235  S-adenosylmethionine decarboxylase  60.89 
 
 		 276 aa  354  1e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000212775  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0737  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  63.36 
 
 		 276 aa  352  2.9999999999999997e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000135532  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0913  S-adenosylmethionine decarboxylase  66.02 
 
 		 264 aa  351  5.9999999999999994e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.365148  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0513  S-adenosylmethionine decarboxylase  57.95 
 
 		 271 aa  307  1.0000000000000001e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0527  S-adenosylmethionine decarboxylase  57.58 
 
 		 271 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2796  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  55.89 
 
 		 270 aa  302  3.0000000000000004e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0630  S-adenosylmethionine decarboxylase  44.06 
 
 		 252 aa  233  4.0000000000000004e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4906  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  26.4 
 
 		 123 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4891  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  27.35 
 
 		 123 aa  47  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5626  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  27.05 
 
 		 123 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000593222 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5061  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  26.4 
 
 		 123 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5446  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  26.4 
 
 		 123 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5302  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  26.05 
 
 		 123 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000919231 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5333  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  25.42 
 
 		 123 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1388  S-adenosylmethionine decarboxylase related  28.46 
 
 		 168 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5378  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  26.5 
 
 		 123 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3365  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  24.43 
 
 		 125 aa  42.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000484703  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0715  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  25.2 
 
 		 124 aa  42.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000012378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>