74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2487 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2487  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  378  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.156401  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2793  hypothetical protein  96.67 
 
 		 180 aa  366  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2159  hypothetical protein  84.44 
 
 		 180 aa  327  7e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000680398 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1286  hypothetical protein  84.44 
 
 		 180 aa  327  7e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1309  hypothetical protein  83.89 
 
 		 180 aa  325  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000362395 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1975  hypothetical protein  83.89 
 
 		 180 aa  325  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.82161  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1324  hypothetical protein  83.89 
 
 		 180 aa  325  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195572  hitchhiker  0.000007708 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1638  hypothetical protein  81.11 
 
 		 180 aa  322  2e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1623  hypothetical protein  81.67 
 
 		 180 aa  319  9.999999999999999e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1230  hypothetical protein  82.78 
 
 		 180 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00205338  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2018  hypothetical protein  82.78 
 
 		 180 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129824 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2215  hypothetical protein  82.78 
 
 		 180 aa  320  9.999999999999999e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.481458  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1488  hypothetical protein  82.78 
 
 		 180 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123276 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2539  protein of unknown function UPF0227  82.78 
 
 		 180 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0228529  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1607  hypothetical protein  78.65 
 
 		 186 aa  318  1.9999999999999998e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.170858  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01112  hypothetical protein  82.22 
 
 		 180 aa  318  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2493  hypothetical protein  82.22 
 
 		 180 aa  318  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.717674  hitchhiker  0.000000248387 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01104  hypothetical protein  82.22 
 
 		 180 aa  318  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1231  hypothetical protein  82.22 
 
 		 180 aa  318  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1593  hypothetical protein  80.56 
 
 		 180 aa  312  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2819  hypothetical protein  80.56 
 
 		 180 aa  312  9.999999999999999e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.524505 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1701  hypothetical protein  80.56 
 
 		 180 aa  312  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1925  hypothetical protein  81.01 
 
 		 180 aa  308  2.9999999999999997e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.389564  hitchhiker  0.0000253614 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1482  hypothetical protein  71.91 
 
 		 179 aa  276  9e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.296836  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003998  putative esterase  69.1 
 
 		 179 aa  273  1.0000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1310  hypothetical protein  67.8 
 
 		 183 aa  271  5.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.510559  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01524  hypothetical protein  67.42 
 
 		 179 aa  270  6e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1944  hypothetical protein  66.1 
 
 		 179 aa  261  4e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.469652 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2415  hypothetical protein  66.1 
 
 		 179 aa  261  4e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.673713  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2404  hypothetical protein  66.1 
 
 		 179 aa  260  6e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464169  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2522  hypothetical protein  65.54 
 
 		 179 aa  259  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.596229  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1727  hypothetical protein  65.54 
 
 		 179 aa  256  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.654156  normal  0.12863 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1806  hypothetical protein  65.54 
 
 		 179 aa  254  3e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2169  hypothetical protein  64.41 
 
 		 185 aa  254  7e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2251  hypothetical protein  65.54 
 
 		 179 aa  253  9e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2292  hypothetical protein  64.97 
 
 		 179 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.407638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1986  hypothetical protein  64.41 
 
 		 179 aa  253  1.0000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.997214  normal  0.536301 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2836  hypothetical protein  62.71 
 
 		 179 aa  248  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00136132  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1808  hypothetical protein  62.15 
 
 		 179 aa  247  7e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0130778  normal  0.0374625 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1627  hypothetical protein  62.71 
 
 		 180 aa  246  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000924391  normal  0.186435 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1540  hypothetical protein  60.11 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000280033  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1327  hypothetical protein  61.24 
 
 		 180 aa  236  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.381305 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0037  protein of unknown function UPF0227  25.67 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65670  hypothetical protein  25.77 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5697  hypothetical protein  28.35 
 
 		 206 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0584  protein of unknown function UPF0227  24.74 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0772  hypothetical protein  27.04 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.40876  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3232  hypothetical protein  29.81 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243033 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4792  hypothetical protein  23.86 
 
 		 202 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.528676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43490  hypothetical protein  25 
 
 		 205 aa  50.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0757  hypothetical protein  28.93 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.168222  hitchhiker  0.00550798 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4916  hypothetical protein  23.86 
 
 		 247 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0817  hypothetical protein  26.29 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.45898  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0810  protein of unknown function UPF0227  26.29 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0617063  unclonable  0.00000000000196592 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0729  hypothetical protein  28.57 
 
 		 191 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000799226 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0785  hypothetical protein  26.29 
 
 		 191 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.841402  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3574  hypothetical protein  26.8 
 
 		 191 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.819327  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0498  hypothetical protein  25.51 
 
 		 202 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1295  protein of unknown function UPF0227  25.64 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.507685  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3559  hypothetical protein  25.15 
 
 		 190 aa  47  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0871904  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4969  hypothetical protein  22.84 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3198  hypothetical protein  24.75 
 
 		 198 aa  45.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0410762 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2284  hydrolase, putative  22.16 
 
 		 188 aa  45.1  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.560152  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4191  hypothetical protein  24.74 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0496837 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3900  hypothetical protein  27.04 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0548  hypothetical protein  26.25 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.728764 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0959  hypothetical protein  21.13 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0943  hypothetical protein  23.33 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000208116 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3044  hypothetical protein  26.67 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.93923 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0778  hypothetical protein  26.67 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0337067  hitchhiker  0.0000000017764 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4964  hypothetical protein  21.65 
 
 		 205 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0938  protein of unknown function UPF0227  20.89 
 
 		 197 aa  41.2  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.330656  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0845  hypothetical protein  27.52 
 
 		 191 aa  40.8  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.294415  normal  0.359517 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0989  hypothetical protein  27.52 
 
 		 191 aa  40.8  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.271686  normal  0.405619 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>