17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_72300 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6275  hypothetical protein  96.14 
 
 
340 aa  657    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72300  hypothetical protein  100 
 
 
346 aa  696    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0036  hypothetical protein  66.67 
 
 
342 aa  455  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326703  normal  0.177153 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0161  hypothetical protein  66.27 
 
 
341 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853384  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0067  hypothetical protein  65.27 
 
 
397 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5084  hypothetical protein  66.77 
 
 
340 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0424557 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0159  hypothetical protein  66.27 
 
 
340 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.860597 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0143  hypothetical protein  65.97 
 
 
341 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109428  normal  0.11094 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0120  hypothetical protein  64.97 
 
 
395 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2156  hypothetical protein  65.38 
 
 
341 aa  432  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00627834  normal  0.0979823 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01770  hypothetical protein  59.94 
 
 
337 aa  375  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3543  hypothetical protein  54.19 
 
 
365 aa  310  2e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.571666  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2394  hypothetical protein  48.24 
 
 
376 aa  282  5.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2318  hypothetical protein  30.17 
 
 
130 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000668387  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0714  hypothetical protein  29.3 
 
 
369 aa  52.8  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0953  hypothetical protein  26.72 
 
 
114 aa  49.7  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1796  hypothetical protein  26.79 
 
 
137 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00914712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>