20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_70590 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_70590  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  265  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6124  hypothetical protein  96.61 
 
 
130 aa  238  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4400  hypothetical protein  76.34 
 
 
131 aa  208  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.188798 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5360  hypothetical protein  73.39 
 
 
124 aa  196  6e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.693226  normal  0.324746 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5312  hypothetical protein  73.39 
 
 
124 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.828219  normal  0.0468247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5221  hypothetical protein  71.77 
 
 
124 aa  193  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.568933  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5025  hypothetical protein  70.97 
 
 
125 aa  188  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.665825 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5470  hypothetical protein  66.94 
 
 
181 aa  187  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0161  hypothetical protein  72.17 
 
 
125 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.323889  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5561  hypothetical protein  69.84 
 
 
128 aa  169  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0312  hypothetical protein  35.25 
 
 
132 aa  93.2  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1169  hypothetical protein  37.29 
 
 
118 aa  92  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4733  hypothetical protein  35.25 
 
 
132 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.760088 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2186  hypothetical protein  30.17 
 
 
189 aa  62  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0146743  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2149  hypothetical protein  29.91 
 
 
168 aa  61.2  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1860  hypothetical protein  29.06 
 
 
168 aa  58.2  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5286  molybdopterin oxidoreductase  22.22 
 
 
992 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3526  molybdopterin oxidoreductase  24.77 
 
 
992 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.286142  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3248  hypothetical protein  32.5 
 
 
119 aa  47.4  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1325  hypothetical protein  23.28 
 
 
118 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>