20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_67460 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_67460  putative lipoprotein  100 
 
 
85 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.52658  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5841  putative lipoprotein  97.65 
 
 
85 aa  168  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0355  putative lipoprotein  77.11 
 
 
84 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0369  putative lipoprotein  77.11 
 
 
84 aa  140  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5169  lipoprotein, putative  77.11 
 
 
84 aa  140  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0426  lipoprotein  86.3 
 
 
84 aa  137  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.613355  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5038  hypothetical protein  86.3 
 
 
84 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5088  hypothetical protein  86.3 
 
 
84 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.614342  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4912  hypothetical protein  86.3 
 
 
84 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45630  hypothetical protein  63.75 
 
 
84 aa  118  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.856651  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0510  hypothetical protein  74.24 
 
 
83 aa  114  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2268  hypothetical protein  41.98 
 
 
82 aa  85.1  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.458864  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0248  hypothetical protein  47.5 
 
 
86 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.727714  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0950  hypothetical protein  44.71 
 
 
86 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0311  putative lipoprotein  41.98 
 
 
90 aa  71.2  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02511  hypothetical protein  42.86 
 
 
100 aa  68.6  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.441191  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0433  hypothetical protein  36.05 
 
 
102 aa  53.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.4404e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2793  putative lipoprotein  28.36 
 
 
196 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.571762  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2734  putative lipoprotein  28.36 
 
 
196 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1770  putative lipoprotein  28.36 
 
 
184 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>