14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_61000 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_61000  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  275  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5250  hypothetical protein  90.28 
 
 
144 aa  211  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3166  hypothetical protein  55.07 
 
 
148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2513  hypothetical protein  54.35 
 
 
148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0620  hypothetical protein  44.76 
 
 
146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0764  hypothetical protein  44.76 
 
 
146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.503732  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4061  hypothetical protein  36.88 
 
 
148 aa  106  9.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13541  hypothetical protein  43.97 
 
 
147 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1023  hypothetical protein  40.44 
 
 
152 aa  103  8e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.271245  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03856  hypothetical protein  43.57 
 
 
147 aa  103  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.857117  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2694  hypothetical protein  40 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1989  hypothetical protein  42.37 
 
 
137 aa  46.2  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.198765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3235  hypothetical protein  37.29 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.980786  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3564  hypothetical protein  33.67 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>