53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_56990 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_56990  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4955  hypothetical protein  85.96 
 
 		 228 aa  407  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592135  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2214  hypothetical protein  36.65 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0189524  normal  0.582651 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0706  hypothetical protein  37.89 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0154953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3351  hypothetical protein  37.24 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.789599  normal  0.0806703 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4378  hypothetical protein  35.05 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0750226  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0740  Putative ParB-like nuclease  34.54 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0727  putative ParB-like nuclease  34.02 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  0.881395 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0701  Putative ParB-like nuclease  34.02 
 
 		 205 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3524  hypothetical protein  36.79 
 
 		 208 aa  99.8  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2235  Putative ParB-like nuclease  34.94 
 
 		 207 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2187  putative ParB-like nuclease  33.33 
 
 		 205 aa  95.5  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0352754  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2350  Putative ParB-like nuclease  34.02 
 
 		 199 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1961  hypothetical protein  36.02 
 
 		 443 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0136529  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1716  putative ParB-like nuclease  38.46 
 
 		 208 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172084 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1271  hypothetical protein  35.26 
 
 		 208 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.335245  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0136  hypothetical protein  35.26 
 
 		 208 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1759  hypothetical protein  35.26 
 
 		 208 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.342395  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1788  hypothetical protein  35.26 
 
 		 208 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185204  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1809  hypothetical protein  35.26 
 
 		 208 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1030  hypothetical protein  35.26 
 
 		 208 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.738741  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2660  putative ParB-like nuclease  34.67 
 
 		 212 aa  92.8  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.683597  normal  0.548694 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2525  hypothetical protein  34.74 
 
 		 208 aa  92  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0224585  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0704  hypothetical protein  35.03 
 
 		 205 aa  91.7  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15967  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4261  putative ParB-like nuclease  35.29 
 
 		 205 aa  91.7  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1460  putative ParB-like nuclease  36.41 
 
 		 208 aa  91.7  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.530245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1420  hypothetical protein  36.41 
 
 		 208 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1668  hypothetical protein  31.66 
 
 		 206 aa  89.4  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0409439 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0887  hypothetical protein  30.73 
 
 		 222 aa  88.6  8e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13631  hypothetical protein  32.99 
 
 		 216 aa  88.2  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4678  hypothetical protein  37.06 
 
 		 208 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0352084  normal  0.199717 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0974  hypothetical protein  30.81 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1058  hypothetical protein  36.92 
 
 		 208 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1538  hypothetical protein  36.92 
 
 		 208 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1514  putative ParB-like nuclease  34.21 
 
 		 208 aa  85.5  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865325  hitchhiker  0.00751547 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4374  hypothetical protein  30.96 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.093636  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4518  putative ParB-like nuclease  31.25 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0880  Putative ParB-like nuclease  31.87 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141868 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5254  putative ParB-like nuclease  32.47 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0513173 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05691  hypothetical protein  25.23 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.222417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2067  putative ParB-like nuclease  33.61 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0264  putative lipoprotein  31.82 
 
 		 380 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2530  putative lipoprotein  31.82 
 
 		 380 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1126  putative lipoprotein  31.82 
 
 		 380 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2351  putative lipoprotein  31.82 
 
 		 380 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1245  putative lipoprotein  34.17 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3403  putative lipoprotein  31.06 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3409  putative lipoprotein  31.06 
 
 		 380 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3368  putative lipoprotein  30.3 
 
 		 380 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3772  hypothetical protein  26.56 
 
 		 378 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0653  putative ParB-like nuclease  33.05 
 
 		 378 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0203  hypothetical protein  33.05 
 
 		 378 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0686  hypothetical protein  33.05 
 
 		 378 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>