11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_53650 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_53650  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  304  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00626606  hitchhiker  0.000571766 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04485  hypothetical protein  45.27 
 
 
231 aa  130  9e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0118  gp30  45.69 
 
 
249 aa  110  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.427468  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1357  gp30  43.97 
 
 
245 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.200548  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2001  gp30  43.1 
 
 
244 aa  97.8  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.274125  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0212  VRR-NUC domain-containing protein  43.62 
 
 
256 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143344  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0643  VRR-NUC domain-containing protein  43.96 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0702  hypothetical protein  37.21 
 
 
251 aa  54.7  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3534  VRR-NUC domain protein  33.33 
 
 
449 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3537  VRR-NUC domain protein  41.67 
 
 
449 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2141  hypothetical protein  32.38 
 
 
427 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>