16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_27930 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_27930  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2358  hypothetical protein  91.92 
 
 		 99 aa  187  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1928  type IV pilus assembly PilZ  51.02 
 
 		 99 aa  100  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.40036 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1911  hypothetical protein  42.55 
 
 		 99 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.309436  hitchhiker  0.00132247 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1681  type IV pilus assembly PilZ  43.01 
 
 		 99 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.936113  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2164  type IV pilus assembly PilZ  40.86 
 
 		 99 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0370021  normal  0.992287 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1705  type IV pilus assembly PilZ  41.94 
 
 		 99 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105671 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2116  hypothetical protein  41.84 
 
 		 99 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.016829  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3578  type IV pilus assembly PilZ  40.86 
 
 		 99 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00410027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1881  type IV pilus assembly PilZ  37.63 
 
 		 96 aa  62  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2244  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.934041  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1111  hypothetical protein  46.05 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2169  type IV pilus assembly PilZ  30.93 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1910  type IV pilus assembly PilZ  35.23 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.060873 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1106  hypothetical protein  27.66 
 
 		 822 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0883  type IV pilus assembly PilZ  31.4 
 
 		 167 aa  40.8  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>