More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_rrlVIMSS1365779 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_rrlVIMSS1365720  23S ribosomal RNA  94.44 
 
 		 2874 bp  4405    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.576306  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rrlVIMSS1365779  23S ribosomal RNA  100 
 
 		 2875 bp  5699    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.069762 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0091  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2907 bp  652    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109092  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0028  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2907 bp  652    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0060  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2908 bp  652    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0141  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2907 bp  652    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.030132  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0066  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2907 bp  652    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0031  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2907 bp  652    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000296907  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5739  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2908 bp  652    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5742  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2908 bp  652    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5745  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2909 bp  652    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00582654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5748  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2908 bp  652    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014193  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5751  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2909 bp  652    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5754  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2909 bp  652    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5757  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2908 bp  652    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5760  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2908 bp  652    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5763  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2908 bp  652    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5766  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2908 bp  652    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000129923  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5769  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2908 bp  652    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00191145  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5772  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2926 bp  652    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000735902  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0037  23S ribosomal RNA  88.81 
 
 		 2826 bp  1370    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0004  23S ribosomal RNA  89.4 
 
 		 2908 bp  660    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0055  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2907 bp  652    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.940507  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0016  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2907 bp  652    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.921086  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0011  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2907 bp  652    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0004  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2908 bp  652    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0060  23S ribosomal RNA  89.4 
 
 		 2908 bp  660    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-1  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2911 bp  652    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-10  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2911 bp  652    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-11  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2911 bp  652    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-2  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2911 bp  652    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-3  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2851 bp  652    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-4  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2911 bp  652    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-5  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2911 bp  652    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-6  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2911 bp  652    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-7  23S ribosomal RNA  89.06 
 
 		 2911 bp  644    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-8  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2911 bp  652    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-9  23S ribosomal RNA  89.06 
 
 		 2911 bp  644    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_1  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2912 bp  652    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_10  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2912 bp  652    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_11  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2911 bp  652    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_12  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2911 bp  652    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_13  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2911 bp  652    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_2  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2911 bp  652    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_3  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2911 bp  652    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_4  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2911 bp  652    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_5  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2911 bp  652    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.759228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_6  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2911 bp  652    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_7  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2911 bp  652    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_8  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2911 bp  652    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_9  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2912 bp  652    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_1  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2911 bp  652    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_10  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2911 bp  652    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_11  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2911 bp  652    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.701116  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_12  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2911 bp  652    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_13  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2911 bp  652    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_2  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2911 bp  652    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_3  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2911 bp  652    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_4  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2911 bp  652    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0824907  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_5  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2911 bp  652    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_6  23S ribosomal RNA  89.46 
 
 		 2911 bp  644    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_rrlVIMSS1365801  23S ribosomal RNA  96.28 
 
 		 2876 bp  4843    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.646586  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_8  23S ribosomal RNA  89.46 
 
 		 2911 bp  644    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_9  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2912 bp  652    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0039  23S ribosomal RNA  94.99 
 
 		 2875 bp  4532    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0009  23S ribosomal RNA  88.8 
 
 		 2830 bp  1346    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.349065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0023  23S ribosomal RNA  88.8 
 
 		 2830 bp  1346    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00726109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0038  23S ribosomal RNA  88.8 
 
 		 2830 bp  1346    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.281895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0050  23S ribosomal RNA  88.8 
 
 		 2830 bp  1346    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0047  23S ribosomal RNA  96.56 
 
 		 2866 bp  4908    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0050  23S ribosomal RNA  96.56 
 
 		 2866 bp  4908    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0019  23S ribosomal RNA  96.66 
 
 		 2866 bp  4926    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.510221 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0048  23S ribosomal RNA  96.66 
 
 		 2866 bp  4926    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0011  23S ribosomal RNA  89.4 
 
 		 2908 bp  660    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_rrlVIMSS1365778  23S ribosomal RNA  99.93 
 
 		 2873 bp  5668    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SA  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2908 bp  652    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.479202  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SB  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2908 bp  652    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SC  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2908 bp  652    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SD  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2908 bp  652    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000431114  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SE  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2908 bp  652    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.842717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SF  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2908 bp  652    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SG  23S ribosomal RNA  89.06 
 
 		 2908 bp  644    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SH  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2908 bp  652    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SI  23S ribosomal RNA  89.06 
 
 		 2908 bp  644    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000225912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SJ  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2908 bp  652    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00026047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SK  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2908 bp  652    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00794568  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0012  23S ribosomal RNA  94.47 
 
 		 2874 bp  4413    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0005  23S ribosomal RNA  88.99 
 
 		 2878 bp  3148    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00100489  normal  0.226788 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0051  23S ribosomal RNA  88.99 
 
 		 2878 bp  3148    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00795869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_rrlVIMSS1365721  23S ribosomal RNA  94.37 
 
 		 2874 bp  4389    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.19888  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0031  23S ribosomal RNA  89.4 
 
 		 2908 bp  660    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0455984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0055  23S ribosomal RNA  89.4 
 
 		 2908 bp  660    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141246  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0026  23S ribosomal RNA  87.47 
 
 		 2881 bp  2339    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0380679  decreased coverage  0.000773701 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0017  23S ribosomal RNA  87.47 
 
 		 2881 bp  2339    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00563866  normal  0.094842 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_rrlVIMSS1365722  23S ribosomal RNA  94.51 
 
 		 2876 bp  4419    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0069  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2908 bp  652    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0072  23S ribosomal RNA  89.23 
 
 		 2907 bp  652    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000119646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0016  23S ribosomal RNA  89.4 
 
 		 2908 bp  660    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158063  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_rrlVIMSS1365723  23S ribosomal RNA  95.13 
 
 		 2874 bp  4569    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0028  23S ribosomal RNA  89.4 
 
 		 2908 bp  660    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>