26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4164 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4164  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  529  1e-149  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0530  hypothetical protein  31.54 
 
 
246 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0510  hypothetical protein  32.54 
 
 
223 aa  123  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.445932  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0483  hypothetical protein  34.25 
 
 
272 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0147  hypothetical protein  33 
 
 
311 aa  99.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000766402  normal  0.195147 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2864  hypothetical protein  31.64 
 
 
241 aa  97.4  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.197887  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1190  hypothetical protein  26.89 
 
 
264 aa  95.9  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1652  hypothetical protein  32.09 
 
 
278 aa  94.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0149  hypothetical protein  31.02 
 
 
304 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0160  hypothetical protein  31.02 
 
 
287 aa  93.2  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.751765  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2769  hypothetical protein  30.62 
 
 
267 aa  92.8  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1702  hypothetical protein  32.43 
 
 
270 aa  89  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0196867  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0142  hypothetical protein  32.18 
 
 
286 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5534  hypothetical protein  28.43 
 
 
259 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257129  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4055  hypothetical protein  28.57 
 
 
271 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.851033  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0571  hypothetical protein  27.75 
 
 
191 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7897  hypothetical protein  28.76 
 
 
198 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1798  hypothetical protein  28.14 
 
 
194 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4387  hypothetical protein  31.21 
 
 
185 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2796  hypothetical protein  34.67 
 
 
191 aa  45.8  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.988633  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0809  hypothetical protein  29.38 
 
 
189 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.184742  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2738  hypothetical protein  30 
 
 
198 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0989  hypothetical protein  29.14 
 
 
183 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16870  hypothetical protein  25.9 
 
 
200 aa  42.7  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.541123  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0979  hypothetical protein  28 
 
 
183 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128032  normal  0.0985074 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0961  hypothetical protein  28 
 
 
183 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>