11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3956 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3956  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 135 aa  277  5e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.104147  normal  0.970496 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2595  PilT domain-containing protein  35.04 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.129291 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3167  PilT domain-containing protein  29.63 
 
 		 135 aa  50.8  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000731556  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00062  PIN domain, putative  30.77 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0134903  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2684  PilT protein domain protein  27.01 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285595  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0447  PilT protein-like  30.43 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.289411 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1457  PilT protein domain protein  25.93 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.767558  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3221  hypothetical protein  27.74 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1364  hypothetical protein  28.37 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2562  PilT domain-containing protein  28.15 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.828362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2132  PilT protein-like  24.09 
 
 		 133 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0313622  normal  0.0299917 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>