13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1691 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1691  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  556  1e-157  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4220  hypothetical protein  35.92 
 
 
249 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.596689 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0829  hypothetical protein  34.8 
 
 
261 aa  125  6e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1227  hypothetical protein  36 
 
 
249 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0996282  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1196  hypothetical protein  36 
 
 
251 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1755  hypothetical protein  27.23 
 
 
230 aa  56.6  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.071754  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0772  hypothetical protein  31.01 
 
 
261 aa  55.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0620  hypothetical protein  31.01 
 
 
261 aa  55.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.228252  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2939  hypothetical protein  32.52 
 
 
290 aa  53.1  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0908  hypothetical protein  26.56 
 
 
256 aa  52.8  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000303993  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0203  hypothetical protein  26.05 
 
 
270 aa  51.2  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2158  hypothetical protein  29.12 
 
 
296 aa  50.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2064  hypothetical protein  38.14 
 
 
296 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000220233 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>