35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_93854 on replicon NC_009370
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009370  OSTLU_93854  predicted protein  100 
 
 
340 aa  700    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00630097  normal  0.0600499 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2214  hypothetical protein  32.92 
 
 
198 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0189524  normal  0.582651 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0706  hypothetical protein  33.54 
 
 
218 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0154953  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0701  Putative ParB-like nuclease  29.63 
 
 
205 aa  57  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4261  putative ParB-like nuclease  29.49 
 
 
205 aa  57  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2187  putative ParB-like nuclease  27.22 
 
 
205 aa  56.2  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0352754  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4518  putative ParB-like nuclease  29.01 
 
 
208 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3351  hypothetical protein  30.57 
 
 
207 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.789599  normal  0.0806703 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2350  Putative ParB-like nuclease  28.3 
 
 
199 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309294  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3524  hypothetical protein  31.01 
 
 
208 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940039  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0704  hypothetical protein  28.57 
 
 
205 aa  54.3  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15967  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2660  putative ParB-like nuclease  30.19 
 
 
212 aa  53.9  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.683597  normal  0.548694 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0727  putative ParB-like nuclease  28.4 
 
 
205 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  0.881395 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1668  hypothetical protein  26.88 
 
 
206 aa  50.8  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0409439 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2067  putative ParB-like nuclease  22.92 
 
 
305 aa  50.8  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2235  Putative ParB-like nuclease  26.11 
 
 
207 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0740  Putative ParB-like nuclease  28.4 
 
 
205 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1514  putative ParB-like nuclease  28.83 
 
 
208 aa  49.3  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865325  hitchhiker  0.00751547 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0880  Putative ParB-like nuclease  27.85 
 
 
205 aa  48.5  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141868 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1538  hypothetical protein  28.83 
 
 
208 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1420  hypothetical protein  28.83 
 
 
208 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1058  hypothetical protein  28.83 
 
 
208 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1460  putative ParB-like nuclease  28.83 
 
 
208 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.530245  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5254  putative ParB-like nuclease  30.33 
 
 
203 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0513173 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4378  hypothetical protein  25.31 
 
 
217 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0750226  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1961  hypothetical protein  27.95 
 
 
443 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0136529  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4678  hypothetical protein  27.33 
 
 
208 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0352084  normal  0.199717 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1271  hypothetical protein  27.5 
 
 
208 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.335245  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1030  hypothetical protein  27.5 
 
 
208 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.738741  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1759  hypothetical protein  27.5 
 
 
208 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.342395  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0136  hypothetical protein  27.5 
 
 
208 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1788  hypothetical protein  27.5 
 
 
208 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185204  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1809  hypothetical protein  27.5 
 
 
208 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2525  hypothetical protein  26.25 
 
 
208 aa  42.7  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0224585  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1716  putative ParB-like nuclease  26.38 
 
 
208 aa  42.4  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00172084 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>