14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_25556 on replicon NC_009368
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009368  OSTLU_25556  predicted protein  100 
 
 
431 aa  885    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00000466514  normal  0.233957 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14780  predicted protein  31.62 
 
 
514 aa  70.9  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.116373 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30906  predicted protein  24.65 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16391  predicted protein  27.32 
 
 
457 aa  60.1  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40473  predicted protein  27.41 
 
 
488 aa  50.8  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48815  predicted protein  26.39 
 
 
519 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46871  ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase small subunit N-methyltransferase I  26.06 
 
 
575 aa  48.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.139312  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57570  predicted protein  26.47 
 
 
611 aa  47  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0322438  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34974  predicted protein  37.08 
 
 
327 aa  47  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00690  SET domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G13520)  28.14 
 
 
480 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18374  predicted protein  27.32 
 
 
375 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.892854  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89730  predicted protein  28.1 
 
 
484 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00881684 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34722  predicted protein  25.94 
 
 
524 aa  45.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0720158  normal  0.0311419 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14074  predicted protein  22.33 
 
 
1280 aa  44.3  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>