38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_12516 on replicon NC_009359
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009359  OSTLU_12516  predicted protein  100 
 
 
339 aa  697    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.343264  normal  0.74988 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24838  type II DNA topoisomerase VI subunit  66.27 
 
 
430 aa  491  9.999999999999999e-139  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0667  DNA topoisomerase VI subunit A  32.54 
 
 
379 aa  217  2e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1552  DNA topoisomerase VI subunit A  34.91 
 
 
369 aa  210  3e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.774461  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2770  DNA topoisomerase VI subunit A  31.7 
 
 
367 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2839  DNA topoisomerase VI subunit A  32.56 
 
 
367 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0943  DNA topoisomerase VI subunit A  32.34 
 
 
367 aa  202  7e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2928  DNA topoisomerase VI subunit A  32.56 
 
 
367 aa  202  8e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3023  DNA topoisomerase VI subunit A  32.56 
 
 
367 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.47746  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0861  DNA topoisomerase VI subunit A  32.1 
 
 
367 aa  196  6e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0732584 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1927  DNA topoisomerase VI subunit A  31.79 
 
 
367 aa  195  9e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.856595  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1392  DNA topoisomerase VI subunit A  32.1 
 
 
367 aa  195  1e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1755  DNA topoisomerase VI subunit A  33.33 
 
 
386 aa  189  4e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0808112  normal  0.29442 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1948  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  33.62 
 
 
389 aa  185  8e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.86374  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1013  DNA topoisomerase VI subunit A  35.09 
 
 
363 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0748  DNA topoisomerase VI subunit A  34.74 
 
 
365 aa  169  9e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1236  DNA topoisomerase VI subunit A  34.39 
 
 
365 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0682  DNA topoisomerase VI subunit A  34.39 
 
 
365 aa  166  5e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0141  DNA topoisomerase VI subunit A  34.04 
 
 
365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0640  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  29.88 
 
 
362 aa  149  5e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2285  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  28.66 
 
 
364 aa  147  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1407  DNA topoisomerase VI subunit A  28.53 
 
 
370 aa  142  7e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1315  DNA topoisomerase VI subunit A  28.1 
 
 
361 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.88306  normal  0.176233 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1202  DNA topoisomerase VI subunit A  28.39 
 
 
373 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.125712  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0417  DNA topoisomerase VI subunit A  27.51 
 
 
365 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.0014669 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2727  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  29.39 
 
 
366 aa  138  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.608904  normal  0.699112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2806  DNA topoisomerase VI subunit A  28.4 
 
 
369 aa  137  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0158591  hitchhiker  0.00294099 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1587  DNA topoisomerase VI subunit A  30.37 
 
 
362 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27014  predicted protein  36.05 
 
 
287 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0279403  normal  0.0136943 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0129  DNA topoisomerase VI subunit A  27.44 
 
 
370 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.437456  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0600  DNA topoisomerase VI subunit A  27.63 
 
 
357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.375144  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1736  DNA topoisomerase VI subunit A  26.49 
 
 
362 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.418676  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2920  DNA topoisomerase VI subunit A  28.73 
 
 
340 aa  130  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36531  type II DNA topoisomerase VI subunit  28.24 
 
 
432 aa  129  9.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2196  DNA topoisomerase VI subunit A  28.52 
 
 
362 aa  126  7e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01330  endodeoxyribonuclease, putative  34.41 
 
 
559 aa  122  8e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0743  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  29.51 
 
 
362 aa  116  6e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.045312  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08259  spo11 homologue spoA (Eurofung)  29.36 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.519645 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>