28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2115 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2115  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  230  6e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5850  hypothetical protein  53.62 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.980958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0432  hypothetical protein  60.87 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5198  hypothetical protein  52.86 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.261014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1114  hypothetical protein  51.25 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.10293  normal  0.465972 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4549  hypothetical protein  44.58 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1530  hypothetical protein  53.62 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.010116  normal  0.139941 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4309  hypothetical protein  43.37 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3037  hypothetical protein  49.32 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.362619  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5643  hypothetical protein  55.88 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.495939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2801  hypothetical protein  55.38 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.346659 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4631  hypothetical protein  53.62 
 
 		 165 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0537767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4264  hypothetical protein  52.17 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.134049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2201  hypothetical protein  52.11 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5556  hypothetical protein  45 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.563792  hitchhiker  0.000681675 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3240  hypothetical protein  54.41 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2504  hypothetical protein  60.34 
 
 		 98 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4117  hypothetical protein  49.3 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.690981  normal  0.511996 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2935  hypothetical protein  48.53 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2463  hypothetical protein  53.85 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.042931  normal  0.181289 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2832  hypothetical protein  50.77 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0471494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3741  hypothetical protein  48.48 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3723  hypothetical protein  43.37 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2211  hypothetical protein  39.19 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.794327  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3817  hypothetical protein  45.45 
 
 		 136 aa  50.1  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2210  ETC complex I subunit conserved region  41.03 
 
 		 248 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3681  hypothetical protein  44.12 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3683  ETC complex I subunit conserved region  33.71 
 
 		 250 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.899268 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>