12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1490 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1490  putative lipoprotein  100 
 
 		 123 aa  251  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0750895  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3300  putative lipoprotein  45.69 
 
 		 126 aa  114  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.346926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3084  putative lipoprotein  46.73 
 
 		 122 aa  105  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.173614 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1600  putative lipoprotein  36.52 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1247  hypothetical protein  34.31 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.0000087542  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3890  hypothetical protein  36.19 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0832551  normal  0.849345 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1302  hypothetical protein  33.33 
 
 		 110 aa  50.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1786  hypothetical protein  34.43 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3293  hypothetical protein  38.46 
 
 		 148 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00908488 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3768  hypothetical protein  29.46 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2357  hypothetical protein  28.07 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2065  hypothetical protein  34.15 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00687144  normal  0.398117 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>