28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1114 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1114  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  225  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.10293  normal  0.465972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3037  hypothetical protein  61.45 
 
 		 186 aa  110  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.362619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2935  hypothetical protein  60.24 
 
 		 171 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2801  hypothetical protein  60.98 
 
 		 162 aa  90.1  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.346659 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3240  hypothetical protein  62.34 
 
 		 158 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5850  hypothetical protein  50.7 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.980958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1530  hypothetical protein  52.78 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.010116  normal  0.139941 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2115  hypothetical protein  51.25 
 
 		 114 aa  77  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5198  hypothetical protein  49.28 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.261014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2832  hypothetical protein  66.67 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0471494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5556  hypothetical protein  52.94 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.563792  hitchhiker  0.000681675 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2463  hypothetical protein  55.56 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.042931  normal  0.181289 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5643  hypothetical protein  40.24 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.495939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2201  hypothetical protein  49.18 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2504  hypothetical protein  53.33 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3723  hypothetical protein  52.46 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4549  hypothetical protein  41.1 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0432  hypothetical protein  47.89 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4309  hypothetical protein  39.73 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4117  hypothetical protein  46.48 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.690981  normal  0.511996 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3741  hypothetical protein  49.23 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3817  hypothetical protein  43.75 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3681  hypothetical protein  51.67 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4631  hypothetical protein  39.18 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0537767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4264  hypothetical protein  38.14 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.134049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2211  hypothetical protein  32.89 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.794327  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3683  ETC complex I subunit conserved region  38.75 
 
 		 250 aa  41.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.899268 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2210  ETC complex I subunit conserved region  39.71 
 
 		 248 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>