64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1318 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1318  RNA-binding S4 domain protein  100 
 
 
265 aa  543  1e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.210837  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1086  RNA-binding S4 domain protein  40.75 
 
 
267 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000637661  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09250  RNA-binding S4 domain protein  39.46 
 
 
262 aa  204  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0028436  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0715  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.33 
 
 
255 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.369549  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0789  RNA-binding S4  37.88 
 
 
263 aa  176  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446217  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1012  RNA-binding S4  36.44 
 
 
259 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865709 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2321  photosystem II S4 domain protein  35.63 
 
 
259 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5081  photosystem II S4 domain-containing protein  35.22 
 
 
259 aa  165  9e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.673535  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2846  photosystem II S4 domain protein  34.27 
 
 
259 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3250  photosystem II S4 domain protein  34.27 
 
 
259 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1889  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.1 
 
 
248 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000373186  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4774  photosystem II S4 domain protein  33.2 
 
 
259 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.789019 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4198  RNA-binding S4  33.6 
 
 
259 aa  154  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113928  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1503  RNA-binding S4  32.39 
 
 
259 aa  150  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41009  predicted protein  33.21 
 
 
303 aa  150  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.106009  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2546  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.39 
 
 
257 aa  149  7e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0803565  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0599  RNA-binding S4 domain protein  31.44 
 
 
260 aa  148  9e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000013354  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3724  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.78 
 
 
255 aa  138  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0195579  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1243  S4 domain protein  35.43 
 
 
255 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000893019  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3911  S4 domain protein  34.53 
 
 
255 aa  135  8e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000445845 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3942  S4 domain-containing protein  34.53 
 
 
255 aa  135  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131052  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1037  RNA-binding S4 domain protein  33.61 
 
 
257 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000298489  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3949  S4 domain protein  34.08 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000108737  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1907  RNA-binding S4 domain protein  30.89 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3639  S4 domain-containing protein  34.08 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000680133  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3998  S4 domain protein  34.98 
 
 
241 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000894164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3656  S4 domain-containing protein  34.08 
 
 
255 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3748  S4 domain-containing protein  33.63 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.125171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4036  s4 domain-containing protein  33.63 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00128697  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0596  RNA-binding S4 domain-containing protein  30.18 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000430784  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1489  cell division protein  32.26 
 
 
265 aa  125  9e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1250  RNA-binding S4 domain-containing protein  30.08 
 
 
268 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000129333  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1275  RNA-binding S4 domain-containing protein  30.08 
 
 
268 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000253973  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2106  S4 domain-containing protein  31.08 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00816123  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1820  S4 domain-containing protein  30.68 
 
 
253 aa  118  9e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000243371  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0756  ylmH protein  31.34 
 
 
220 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.031626  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1347  RNA-binding S4 domain protein  29.96 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000348222  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2360  RNA-binding S4 domain-containing protein  29.25 
 
 
263 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000894269  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0920  RNA-binding S4 domain protein  31.44 
 
 
255 aa  102  5e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000818747  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17841  S4-like domain-containing protein  27.82 
 
 
262 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.348814  normal  0.852292 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0781  cell division protein  28.12 
 
 
266 aa  98.6  9e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0824201  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1198  cell division protein  25.53 
 
 
265 aa  97.1  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0928  RNA-binding S4  28.2 
 
 
262 aa  97.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.618898  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1264  RNA-binding S4 domain protein  28.92 
 
 
245 aa  96.7  4e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2058  cell division protein  26.62 
 
 
263 aa  94.4  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4044  RNA-binding S4 domain protein  34.72 
 
 
265 aa  92.8  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223229  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0483  ylmH protein  25.79 
 
 
262 aa  90.5  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2152  RNA-binding S4  26.72 
 
 
258 aa  87.4  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.224826  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05221  S4-like domain-containing protein  25.42 
 
 
295 aa  86.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0525  RNA-binding S4  27.64 
 
 
261 aa  86.7  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14111  hypothetical protein  28.4 
 
 
262 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.531857  normal  0.068656 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1140  cell division protein  25.9 
 
 
256 aa  80.1  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1296  hypothetical protein  29.64 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1087  RNA-binding S4 domain protein  30.87 
 
 
255 aa  72.4  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15571  S4-like domain-containing protein  24.88 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1454  RNA-binding S4  24.58 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15421  S4-like domain-containing protein  26.42 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0340616  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15171  S4-like domain-containing protein  27.67 
 
 
263 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2761  RNA-binding S4 domain-containing protein  27 
 
 
227 aa  67  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2020  RNA-binding S4  26.7 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0877  RNA-binding S4 domain protein  27.45 
 
 
231 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0953  RNA-binding S4 domain protein  25.29 
 
 
259 aa  59.7  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0318  ribosomal protein S4  38.57 
 
 
206 aa  42.4  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.665336  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  37.84 
 
 
208 aa  42  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>