11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0848 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0848  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  273  5e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.276759 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0850  hypothetical protein  38.78 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.407924 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1387  hypothetical protein  28.06 
 
 
200 aa  51.6  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0371  hypothetical protein  32.05 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37992e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1345  hypothetical protein  27.34 
 
 
222 aa  47.8  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.405691  decreased coverage  0.0000428453 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6425  hypothetical protein  29.85 
 
 
154 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1720  hypothetical protein  28.12 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000883152  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0847  hypothetical protein  26.83 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1449  hypothetical protein  38.89 
 
 
162 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5433  hypothetical protein  33.85 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00625909  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2938  hypothetical protein  30.43 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.904567 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>