11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4448 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4448  putative integral membrane protein  100 
 
 		 239 aa  449  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.440749  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1132  hypothetical protein  43.86 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0602  ABC transporter protein  42.29 
 
 		 238 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0451  hypothetical protein  39.71 
 
 		 239 aa  122  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1855  hypothetical protein  43.75 
 
 		 237 aa  122  7e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.076354  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4275  hypothetical protein  45.11 
 
 		 238 aa  106  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.273706  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4167  hypothetical protein  39.25 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000450239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0978  hypothetical protein  32.69 
 
 		 264 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377564  normal  0.0241309 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3787  hypothetical protein  37.3 
 
 		 236 aa  92.4  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06890  hypothetical protein  34.16 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.390975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3974  hypothetical protein  30.18 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0800365  normal  0.28897 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>