47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4266 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4266  hypothetical protein  100 
 
 
350 aa  697    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0927  hypothetical protein  48.52 
 
 
341 aa  268  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0086  hypothetical protein  30.55 
 
 
278 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  26.91 
 
 
286 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  26.91 
 
 
286 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13588  hypothetical protein  31.14 
 
 
289 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0436638 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  29.96 
 
 
306 aa  65.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4629  hypothetical protein  25.89 
 
 
277 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4717  hypothetical protein  25.89 
 
 
277 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  31.62 
 
 
284 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  31.62 
 
 
284 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  31.62 
 
 
284 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4361  hypothetical protein  25.97 
 
 
289 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0126978 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5011  hypothetical protein  24.56 
 
 
277 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4275  hypothetical protein  25.97 
 
 
289 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0774352  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13746  hypothetical protein  29.17 
 
 
296 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00180958  normal  0.465684 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4654  hypothetical protein  25.85 
 
 
289 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397587  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4812  hypothetical protein  27.6 
 
 
307 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00673201 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1289  hypothetical protein  26.67 
 
 
294 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17962  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5526  hypothetical protein  27.32 
 
 
298 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3899  hypothetical protein  29.75 
 
 
289 aa  57.4  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4384  hypothetical protein  30.13 
 
 
281 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.88032  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4228  hypothetical protein  29.49 
 
 
281 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331823  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4153  hypothetical protein  29.49 
 
 
281 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11511  hypothetical protein  23.36 
 
 
280 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.494625 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1630  hypothetical protein  26.42 
 
 
307 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3288  hypothetical protein  27.3 
 
 
313 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11091  hypothetical protein  26.4 
 
 
283 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0879835  normal  0.520247 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1730  hypothetical protein  25.38 
 
 
288 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432935  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0599  hypothetical protein  30.81 
 
 
290 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0608  hypothetical protein  30.81 
 
 
290 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0621  hypothetical protein  30.81 
 
 
290 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13550  hypothetical protein  27.48 
 
 
279 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000138397  hitchhiker  0.00000300083 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  29.8 
 
 
294 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20280  hypothetical protein  37.61 
 
 
330 aa  46.6  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  29.52 
 
 
295 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05730  hypothetical protein  24.88 
 
 
297 aa  45.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0991  hypothetical protein  36.19 
 
 
318 aa  45.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  30.97 
 
 
259 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4530  hypothetical protein  28.36 
 
 
291 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.724398  normal  0.679375 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1165  hypothetical protein  36.84 
 
 
302 aa  43.9  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000066316 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4443  hypothetical protein  28.36 
 
 
291 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.353827  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1355  hypothetical protein  26.85 
 
 
335 aa  43.5  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0634709  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27230  hypothetical protein  34.88 
 
 
321 aa  43.1  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0912  hypothetical protein  26.72 
 
 
289 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0938391  normal  0.0123481 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2902  hypothetical protein  26.23 
 
 
319 aa  42.7  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5229  hypothetical protein  38.57 
 
 
291 aa  42.7  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>