36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3945 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3945  hypothetical protein  100 
 
 		 758 aa  1432    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.404517  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34230  hypothetical protein  43.61 
 
 		 751 aa  424  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.604302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0814  hypothetical protein  42.57 
 
 		 790 aa  411  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0463  hypothetical protein  43.82 
 
 		 747 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0804  hypothetical protein  42.84 
 
 		 752 aa  404  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.613631  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3610  hypothetical protein  43.33 
 
 		 789 aa  404  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.746479  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3295  hypothetical protein  45.83 
 
 		 857 aa  394  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8905  hypothetical protein  40.33 
 
 		 789 aa  385  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.826763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1699  hypothetical protein  40.16 
 
 		 748 aa  362  1e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.713672 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4401  hypothetical protein  38.12 
 
 		 837 aa  361  4e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.433686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4867  hypothetical protein  39.95 
 
 		 764 aa  360  6e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0900282 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4571  hypothetical protein  39.82 
 
 		 764 aa  359  8e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0747645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4484  hypothetical protein  39.89 
 
 		 739 aa  359  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5054  hypothetical protein  39.73 
 
 		 751 aa  347  6e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4339  hypothetical protein  39.85 
 
 		 820 aa  337  5.999999999999999e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4772  hypothetical protein  38.52 
 
 		 758 aa  329  1.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10879  hypothetical protein  36.19 
 
 		 756 aa  328  3e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.112586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8093  hypothetical protein  40.94 
 
 		 761 aa  327  4.0000000000000003e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0172  hypothetical protein  38.5 
 
 		 876 aa  302  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.211375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3948  hypothetical protein  39.77 
 
 		 820 aa  300  7e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1222  hypothetical protein  35.17 
 
 		 777 aa  294  3e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0906  hypothetical protein  33.41 
 
 		 826 aa  284  5.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.504843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0508  hypothetical protein  34.06 
 
 		 759 aa  278  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0788  hypothetical protein  32.97 
 
 		 834 aa  278  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21530  hypothetical protein  36.34 
 
 		 779 aa  259  9e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636597  hitchhiker  0.000150797 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0815  hypothetical protein  35.56 
 
 		 726 aa  259  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0726  hypothetical protein  40.52 
 
 		 817 aa  242  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0231396  hitchhiker  0.000141757 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0847  hypothetical protein  35.96 
 
 		 762 aa  220  6e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.435932  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2931  hypothetical protein  44.65 
 
 		 745 aa  209  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31420  hypothetical protein  42.01 
 
 		 953 aa  207  6e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.937123  normal  0.115197 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07970  hypothetical protein  34.12 
 
 		 719 aa  190  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.281688  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2510  hypothetical protein  32.14 
 
 		 798 aa  169  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90638 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3427  hypothetical protein  28.83 
 
 		 840 aa  164  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2048  hypothetical protein  31.52 
 
 		 822 aa  162  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1999  hypothetical protein  35.41 
 
 		 856 aa  112  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0638496 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3752  Helix-turn-helix type 11 domain protein  36.28 
 
 		 235 aa  48.5  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>