19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3371 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3371  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  325  1.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2394  hypothetical protein  54.61 
 
 		 157 aa  157  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000734889  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1024  Domain of unknown function DUF1801  53.59 
 
 		 152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.187798  normal  0.287584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0555  hypothetical protein  55.4 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2079  Domain of unknown function DUF1801  51.68 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0297995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1178  hypothetical protein  50.39 
 
 		 128 aa  133  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3434  hypothetical protein  50.36 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0744496  normal  0.059661 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8844  hypothetical protein  49.65 
 
 		 146 aa  132  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2642  hypothetical protein  45.81 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0511  hypothetical protein  48.92 
 
 		 141 aa  120  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2173  hypothetical protein  47.14 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.294686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2344  hypothetical protein  48.59 
 
 		 160 aa  110  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.612858  normal  0.355354 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4098  hypothetical protein  46 
 
 		 160 aa  107  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.369529  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0788  hypothetical protein  43.23 
 
 		 180 aa  104  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.571735  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1217  hypothetical protein  46.94 
 
 		 153 aa  104  6e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.889377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22220  protein of unknown function (DU1801)  38.13 
 
 		 99 aa  72  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2458  Domain of unknown function DUF1801  30.71 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0934396  hitchhiker  0.00000261825 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19540  protein of unknown function (DU1801)  30.65 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3419  hypothetical protein  26.89 
 
 		 120 aa  43.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>