24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2694 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2694  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1061  hypothetical protein  56.25 
 
 
78 aa  84.3  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.934196  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0070  hypothetical protein  55.22 
 
 
68 aa  84  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0704  hypothetical protein  61.02 
 
 
69 aa  83.6  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0302  hypothetical protein  54.1 
 
 
172 aa  82  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00596273  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0335  hypothetical protein  58.46 
 
 
85 aa  81.3  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1912  pressure-regulated protein  53.85 
 
 
79 aa  80.5  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.348947  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1721  hypothetical protein  58.62 
 
 
70 aa  80.1  0.000000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.714124 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1121  hypothetical protein  56.25 
 
 
69 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3643  hypothetical protein  60.34 
 
 
94 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3496  hypothetical protein  56.67 
 
 
66 aa  77  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1261  hypothetical protein  57.63 
 
 
71 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00450437  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1022  hypothetical protein  51.56 
 
 
66 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.433124  normal  0.431545 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0952  hypothetical protein  52.31 
 
 
66 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.938842  normal  0.0299289 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0887  hypothetical protein  53.12 
 
 
66 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.981271  normal  0.0696523 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1765  hypothetical protein  48.44 
 
 
74 aa  69.3  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0504773  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53450  hypothetical protein  47.37 
 
 
66 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00993995  normal  0.0130704 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1008  hypothetical protein  45.45 
 
 
75 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119235  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1073  hypothetical protein  45.9 
 
 
153 aa  63.5  0.0000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.177895  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0881  hypothetical protein  46.55 
 
 
71 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.999097  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0814  hypothetical protein  48.21 
 
 
95 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0775  hypothetical protein  48.21 
 
 
100 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.186376  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1170  hypothetical protein  44.83 
 
 
75 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0800  hypothetical protein  41.86 
 
 
54 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0895866 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>