99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2664 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2664  rare lipoprotein B  100 
 
 		 161 aa  322  1e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167141  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0543  rare lipoprotein B  33.99 
 
 		 172 aa  95.5  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1201  Rare lipoprotein B  39.31 
 
 		 175 aa  92  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.877221  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2278  rare lipoprotein B  34.51 
 
 		 177 aa  85.5  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2833  rare lipoprotein B  29.49 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3785  rare lipoprotein B  33.33 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2972  rare lipoprotein B  28.97 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4604  rare lipoprotein B  32.21 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1301  hypothetical protein  27.7 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1300  hypothetical protein  27.7 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2156  rare lipoprotein B  27.4 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1452  rare lipoprotein B  30 
 
 		 172 aa  70.9  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.334843  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1743  putative lipoprotein B precursor  29.14 
 
 		 187 aa  70.5  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0430569  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0759  rare lipoprotein B  34.21 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2444  putative lipoprotein B precursor transmembrane  33.33 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.553692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1310  rare lipoprotein B  28.4 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1377  rare lipoprotein B precursor  28.4 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0925703  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0512  rare lipoprotein B  33.77 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2743  putative lipoprotein B precursor transmembrane  27.03 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4958  rare lipoprotein B  27.1 
 
 		 201 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.665092 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12210  hypothetical protein  26.28 
 
 		 207 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2572  Rare lipoprotein B  26.35 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136179  normal  0.613264 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2982  Rare lipoprotein B  25.68 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4813  lipoprotein, putative  25.48 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3703  rare lipoprotein B  34.06 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00988017  hitchhiker  0.0000022488 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1120  hypothetical protein  25.64 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3480  rare lipoprotein B  33.82 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0408224  hitchhiker  0.000000129712 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01875  lipoprotein  29.29 
 
 		 181 aa  63.9  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.920687  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4353  rare lipoprotein B  25.48 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2864  rare lipoprotein B  29.33 
 
 		 164 aa  62  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012268  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2911  Rare lipoprotein B  27.59 
 
 		 194 aa  62  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2131  Rare lipoprotein B  32.41 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.1085 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1097  Rare lipoprotein B  29.17 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0312036  hitchhiker  0.000000000546863 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3448  rare lipoprotein B  29.17 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.124406  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3270  rare lipoprotein B  28.48 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.527962  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0480  rare lipoprotein B  28.87 
 
 		 190 aa  60.8  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3312  rare lipoprotein B  29.86 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000159395  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2587  rare lipoprotein B  30.57 
 
 		 183 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.890824  hitchhiker  0.0000000000573442 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0550  rare lipoprotein B  29.53 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.951717  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4795  rare lipoprotein B  26.28 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.167693 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0576  rare lipoprotein B  29.53 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0233  rare lipoprotein B precursor  24.84 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0655  rare lipoprotein B  27.52 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0172  rare lipoprotein B  27.52 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0626  rare lipoprotein B  28.3 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3144  rare lipoprotein B  31.37 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000366189  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0369  putative lipoprotein  27.56 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1212  putative lipoprotein  26.92 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0622  rare lipoprotein B  28.21 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.696129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3450  putative lipoprotein  26.92 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.978876  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2452  putative lipoprotein  27.56 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2639  putative lipoprotein  27.56 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1228  putative lipoprotein  27.56 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3449  putative lipoprotein  27.56 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3414  putative lipoprotein  27.56 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0996  rare lipoprotein B  28.47 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.106946  normal  0.100935 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1000  rare lipoprotein B  28.47 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115178  normal  0.163142 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1173  rare lipoprotein B  28.47 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1061  rare lipoprotein B  28.47 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.702288  hitchhiker  0.00672321 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3787  rare lipoprotein B  24.52 
 
 		 203 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0786655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1072  rare lipoprotein B  31.54 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4670  rare lipoprotein B  26.11 
 
 		 201 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0217  putative lipoprotein B precursor  28.86 
 
 		 169 aa  57  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1565  rare lipoprotein B  27.15 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2731  rare lipoprotein B  29.14 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2930  rare lipoprotein B  29.87 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.692064  decreased coverage  0.00636409 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3741  rare lipoprotein B  28.19 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0664658 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0401  rare lipoprotein B-like protein  29.45 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258768  normal  0.553058 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6002  rare lipoprotein B  24.83 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2583  rare lipoprotein B  27.89 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.446935 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4547  rare lipoprotein B  30.57 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3265  Rare lipoprotein B  26.85 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3916  rare lipoprotein B  26.85 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0577  rare lipoprotein B  28.1 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.330293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4848  rare lipoprotein B  25.64 
 
 		 201 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1190  rare lipoprotein B  28.87 
 
 		 171 aa  53.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0796  rare lipoprotein B  28.76 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.256578  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1186  LPS-assembly lipoprotein RlpB  24 
 
 		 184 aa  52  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0423  Rare lipoprotein B  29.73 
 
 		 173 aa  51.2  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0704  rare lipoprotein B  26.75 
 
 		 169 aa  51.2  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00180129  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3379  rare lipoprotein B  29.11 
 
 		 183 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000235513 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3145  LPS-assembly lipoprotein RlpB  23.33 
 
 		 184 aa  50.4  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0672  hypothetical protein  26.11 
 
 		 206 aa  50.1  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00531564  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1507  rare lipoprotein B precursor  26.11 
 
 		 183 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0236353  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08990  hypothetical protein  27.61 
 
 		 208 aa  49.7  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518811  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2745  rare lipoprotein B  23.18 
 
 		 191 aa  48.9  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1721  rare lipoprotein B  27.33 
 
 		 167 aa  48.9  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1097  LPS-assembly lipoprotein RlpB  22.3 
 
 		 182 aa  48.5  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.590366  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1556  rare lipoprotein B  28.19 
 
 		 167 aa  48.5  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.22375  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1206  LPS-assembly lipoprotein RlpB  22.92 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.730747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2959  LPS-assembly lipoprotein RlpB  25.66 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3309  hypothetical protein  27.74 
 
 		 170 aa  45.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0269686 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2144  rare lipoprotein B  28.48 
 
 		 173 aa  45.1  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0458  rare lipoprotein B, putative  26.21 
 
 		 172 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0618  Rare lipoprotein B-like protein  26.21 
 
 		 172 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1843  LPS-assembly lipoprotein RlpB  22.92 
 
 		 207 aa  41.6  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2927  LPS-assembly lipoprotein RlpB  22.92 
 
 		 207 aa  41.6  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3016  LPS-assembly lipoprotein RlpB  22.92 
 
 		 207 aa  41.6  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.446987  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0989  rare lipoprotein B precursor  22 
 
 		 210 aa  41.2  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>