15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1877 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1877  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0768  protein of unknown function UPF0153  33.51 
 
 		 198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.932399 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4386  protein of unknown function UPF0153  36.02 
 
 		 228 aa  112  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  0.783994 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1651  hypothetical protein  29.35 
 
 		 138 aa  52.4  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.396614  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2938  protein of unknown function UPF0153  36.26 
 
 		 134 aa  49.7  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0781616  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0856  hypothetical protein  37.11 
 
 		 97 aa  48.9  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1819  hypothetical protein  37.33 
 
 		 100 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0698228  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2546  hypothetical protein  42.42 
 
 		 115 aa  47.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.211724  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0137  hypothetical protein  32.89 
 
 		 118 aa  45.4  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2221  hypothetical protein  34.67 
 
 		 95 aa  45.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2539  protein of unknown function UPF0153  37.29 
 
 		 116 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1958  hypothetical protein  33.33 
 
 		 104 aa  42.7  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.781957  normal  0.865529 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3321  hypothetical protein  34.25 
 
 		 96 aa  42.4  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2318  hypothetical protein  39.39 
 
 		 100 aa  42.4  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2061  hypothetical protein  47.73 
 
 		 88 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.212538  normal  0.60183 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>