14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1628 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1628  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  259  1e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3050  hypothetical protein  48.41 
 
 
127 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3072  hypothetical protein  48.41 
 
 
127 aa  123  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.283945  normal  0.874986 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0445  hypothetical protein  42.5 
 
 
142 aa  93.2  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1608  hypothetical protein  44.34 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.125339  normal  0.6223 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1877  hypothetical protein  35.54 
 
 
134 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0290  hypothetical protein  34.43 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0432  hypothetical protein  35.96 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2727  hypothetical protein  32.46 
 
 
133 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0568  hypothetical protein  32.56 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0168206  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1202  hypothetical protein  35.14 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000142447  hitchhiker  0.00000387981 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1104  hypothetical protein  27.64 
 
 
147 aa  47.8  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000403669  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0022  hypothetical protein  28.93 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0522  hypothetical protein  29.7 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.62682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>