21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1472 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1472  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  545  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1386  hypothetical protein  37.8 
 
 
133 aa  101  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1342  hypothetical protein  37.8 
 
 
132 aa  101  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000352392  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1809  hypothetical protein  35.66 
 
 
132 aa  95.1  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.610653  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1492  hypothetical protein  30.65 
 
 
135 aa  77.4  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1781  UspA domain-containing protein  31.09 
 
 
285 aa  63.2  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2066  hypothetical protein  26.61 
 
 
135 aa  55.8  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2519  hypothetical protein  29.17 
 
 
120 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.063986  normal  0.852215 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0160  hypothetical protein  29.75 
 
 
120 aa  49.3  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0759  hypothetical protein  26.61 
 
 
120 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0839  hypothetical protein  28.45 
 
 
120 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360004 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1011  hypothetical protein  26.61 
 
 
120 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.116392  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2442  UspA domain-containing protein  28.7 
 
 
131 aa  47.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1323  hypothetical protein  26.42 
 
 
120 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.804067  normal  0.155599 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2602  hypothetical protein  29.03 
 
 
127 aa  45.8  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0738008  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1509  hypothetical protein  27.12 
 
 
114 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.322803  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1487  hypothetical protein  27.12 
 
 
114 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3336  hypothetical protein  26.5 
 
 
184 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.185768  normal  0.354376 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1485  hypothetical protein  25 
 
 
121 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2063  hypothetical protein  27.35 
 
 
121 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5736  hypothetical protein  24.8 
 
 
130 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.853657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>