51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1969 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1877  hypothetical protein  65.21 
 
 
587 aa  748    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.220347  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1969  hypothetical protein  100 
 
 
581 aa  1195    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2694  TPR repeat-containing protein  47.19 
 
 
580 aa  488  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.407623  normal  0.0520639 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1851  TPR repeat-containing protein  45.68 
 
 
571 aa  457  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0555  tetratricopeptide region  42.47 
 
 
560 aa  454  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.45789  normal  0.384774 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2335  Tetratricopeptide domain protein  45.23 
 
 
563 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014328 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2869  hypothetical protein  44.17 
 
 
568 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.451672  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3429  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.83 
 
 
572 aa  445  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2675  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45.22 
 
 
572 aa  445  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1371  TPR repeat-containing protein  42.23 
 
 
601 aa  426  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0432859  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4467  Tetratricopeptide repeat protein  43.13 
 
 
568 aa  427  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412623  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2264  hypothetical protein  42.42 
 
 
621 aa  422  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.750308  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20870  Tetratricopeptide repeat (TPR) protein  45.54 
 
 
539 aa  414  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1581  Tetratricopeptide domain protein  42.39 
 
 
578 aa  402  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00337533  normal  0.487012 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2307  TPR repeat-containing protein  42.38 
 
 
598 aa  387  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.062343 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0768  TPR repeat-containing protein  38.88 
 
 
552 aa  368  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2863  TPR repeat-containing protein  39.83 
 
 
525 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0105182  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3942  TPR repeat-containing protein  37.55 
 
 
563 aa  324  3e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal  0.567153 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4301  TPR repeat-containing protein  38.52 
 
 
625 aa  323  5e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1486  TPR repeat-containing protein  39.8 
 
 
623 aa  322  9.999999999999999e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0989  hypothetical protein  36.48 
 
 
577 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.659659  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1004  TPR repeat-containing protein  38.15 
 
 
625 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3291  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.67 
 
 
625 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1317  TPR repeat-containing protein  39.14 
 
 
533 aa  291  3e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.573669  normal  0.99771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2769  tetratricopeptide TPR_2  34.8 
 
 
563 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.156917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2813  TPR repeat-containing protein  34.8 
 
 
563 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.48594  normal  0.196641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2796  TPR repeat-containing protein  34.8 
 
 
563 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.489638  normal  0.742166 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02878  conserved hypothetical protein  34.38 
 
 
594 aa  261  2e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.291051 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03987  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G00240)  33.39 
 
 
580 aa  258  2e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3057  TPR repeat-containing protein  35.23 
 
 
559 aa  254  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.297776 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0381  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.56 
 
 
559 aa  250  4e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.850569  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4326  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.77 
 
 
584 aa  250  6e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03470  conserved expressed protein  32.14 
 
 
576 aa  248  1e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0846142  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3331  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
565 aa  244  3e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.643296  normal  0.0437808 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1465  TPR repeat-containing protein  33.4 
 
 
574 aa  243  6e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.388393  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2608  TPR domain-containing protein  33.4 
 
 
601 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1379  TPR repeat-containing protein  33.4 
 
 
559 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1113  TPR repeat-containing protein  33.02 
 
 
537 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0462  TPR domain-containing protein  33.02 
 
 
537 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0186  TPR domain-containing protein  33.02 
 
 
537 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.240778  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1219  TPR domain-containing protein  33.02 
 
 
537 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121944  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02657  conserved hypothetical protein  31.1 
 
 
600 aa  229  1e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000025246  normal  0.0917143 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38668  predicted protein  28.73 
 
 
626 aa  174  3.9999999999999995e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0793283  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3941  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.74 
 
 
871 aa  115  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.817968  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1942  tetratricopeptide TPR_4  26.01 
 
 
530 aa  106  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3655  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 
506 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2242  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 
541 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433133  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5657  tetratricopeptide TPR_4  24.29 
 
 
530 aa  94.7  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1061  tetratricopeptide domain-containing protein  26.42 
 
 
556 aa  85.9  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2073  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 
532 aa  63.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2168  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.65 
 
 
537 aa  57  0.0000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>