14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2872 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2872  Flagella accessory C family protein  100 
 
 
811 aa  1578    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.899166  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2868  Flagella accessory C family protein  38.4 
 
 
482 aa  156  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.794531  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0234  flagella protein  65.67 
 
 
553 aa  85.1  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.776168  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0956  flagella protein  30.74 
 
 
573 aa  79.3  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.451324  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2564  Flagella accessory C family protein  33.33 
 
 
620 aa  66.6  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.840692  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1942  flagella protein  36.96 
 
 
162 aa  58.2  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81688  E3 ubiquitin protein ligase TOM1 (Temperature dependent-organization in mitotic nucleus protein 1)  27.32 
 
 
3268 aa  50.1  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.325065 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0143  flagella protein  29.27 
 
 
348 aa  50.1  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.626308  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0687  flagella protein  36.17 
 
 
165 aa  49.3  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.659141  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1570  flagella protein  30.91 
 
 
428 aa  47.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3410  hypothetical protein  31.82 
 
 
152 aa  46.2  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3416  Flagella accessory C family protein  32.81 
 
 
391 aa  46.2  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0261  flagella accessory C family protein  32.79 
 
 
181 aa  45.4  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0653102  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1246  flagella protein  28.24 
 
 
706 aa  45.1  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.774544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>