16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4652 on replicon NC_007961
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007961  Nham_4652  hypothetical protein  100 
 
 		 60 aa  122  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.659155  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4969  hypothetical protein  88.33 
 
 		 60 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553476  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9156  Helicase subunit of the DNA excision repair complex  60 
 
 		 115 aa  80.5  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4469  hypothetical protein  61.67 
 
 		 58 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0261  hypothetical protein  60 
 
 		 58 aa  70.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4310  hypothetical protein  54.84 
 
 		 62 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0646462  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8076  hypothetical protein  59.26 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0372  hypothetical protein  59.18 
 
 		 52 aa  56.6  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2788  hypothetical protein  53.85 
 
 		 55 aa  56.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5552  hypothetical protein  47.27 
 
 		 56 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.423548  normal  0.0424308 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2631  hypothetical protein  55.1 
 
 		 54 aa  50.4  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5530  hypothetical protein  41.82 
 
 		 56 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.101899 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3834  hypothetical protein  40 
 
 		 57 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100486  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0767  hypothetical protein  45.28 
 
 		 93 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2499  hypothetical protein  42.86 
 
 		 80 aa  43.9  0.0009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.421423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4969  hypothetical protein  33.96 
 
 		 54 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.689573 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>