24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4549 on replicon NC_007961
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007961  Nham_4549  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  256  7e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4309  hypothetical protein  98.41 
 
 		 126 aa  253  6e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2115  hypothetical protein  44.05 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5850  hypothetical protein  52.78 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.980958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5198  hypothetical protein  51.47 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.261014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4631  hypothetical protein  45.16 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0537767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4264  hypothetical protein  38.71 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.134049 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3741  hypothetical protein  38.21 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3817  hypothetical protein  40.7 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1530  hypothetical protein  47.06 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.010116  normal  0.139941 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0432  hypothetical protein  45.07 
 
 		 164 aa  62  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1114  hypothetical protein  36.56 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.10293  normal  0.465972 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5643  hypothetical protein  44.93 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.495939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4117  hypothetical protein  43.24 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.690981  normal  0.511996 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5556  hypothetical protein  40.24 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.563792  hitchhiker  0.000681675 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3240  hypothetical protein  45.9 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3037  hypothetical protein  37.31 
 
 		 186 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.362619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2201  hypothetical protein  46.77 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2801  hypothetical protein  42.42 
 
 		 162 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.346659 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2832  hypothetical protein  44.83 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0471494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2504  hypothetical protein  46.55 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2210  ETC complex I subunit conserved region  38.24 
 
 		 248 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3723  hypothetical protein  40.28 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2935  hypothetical protein  38.18 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>