15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4501 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007960  Nham_4501  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  820    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0854244  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5331  putative cytoplasmic protein  63.57 
 
 		 389 aa  502  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2528  hypothetical protein  61.08 
 
 		 403 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.122585  hitchhiker  0.000213496 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3313  conserved hypothetical cytosolic protein  59.54 
 
 		 398 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15600  hypothetical protein  59.64 
 
 		 394 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000896111  unclonable  6.48725e-22 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0265  hypothetical protein  57.62 
 
 		 391 aa  442  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.77928  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1964  Putative helicase A859L  55.19 
 
 		 403 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112018  normal  0.0337679 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1284  YeeC-like protein  55.58 
 
 		 397 aa  425  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000112385 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3048  YeeC-like protein  58.98 
 
 		 392 aa  423  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1752  YeeC-like protein  55.78 
 
 		 391 aa  419  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.870079  normal  0.552077 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3041  hypothetical protein  34.57 
 
 		 419 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0030  hypothetical protein  33.86 
 
 		 446 aa  195  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1467  hypothetical protein  33.59 
 
 		 444 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0761  hypothetical protein  32.73 
 
 		 398 aa  184  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0739979  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15100  T5orf172 domain-containing protein  43.75 
 
 		 71 aa  55.1  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.177671  normal  0.7549 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>