16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4478 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007960  Nham_4478  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  321  3e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0255771  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4318  hypothetical protein  58.6 
 
 
158 aa  185  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4147  hypothetical protein  53.5 
 
 
158 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4977  hypothetical protein  55.13 
 
 
158 aa  181  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9554  hypothetical protein  50.96 
 
 
158 aa  174  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409532  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8094  hypothetical protein  53.74 
 
 
157 aa  174  6e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.18901  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4751  hypothetical protein  55.24 
 
 
157 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0273  hypothetical protein  52.87 
 
 
158 aa  170  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4660  hypothetical protein  50.32 
 
 
158 aa  168  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.928661  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9166  hypothetical protein  52.87 
 
 
156 aa  168  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3152  hypothetical protein  50.32 
 
 
158 aa  166  8e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.139479  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4595  hypothetical protein  49.68 
 
 
158 aa  166  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0428706  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3820  hypothetical protein  49.68 
 
 
157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.487425  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0379  hypothetical protein  45.22 
 
 
157 aa  142  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4959  hypothetical protein  48.57 
 
 
216 aa  142  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.347488  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4752  hypothetical protein  45.86 
 
 
157 aa  135  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.343573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>