24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4469 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007960  Nham_4469  hypothetical protein  100 
 
 		 58 aa  122  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0261  hypothetical protein  87.93 
 
 		 58 aa  113  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4969  hypothetical protein  66.67 
 
 		 60 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553476  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4652  hypothetical protein  61.67 
 
 		 60 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.659155  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9156  Helicase subunit of the DNA excision repair complex  55 
 
 		 115 aa  66.6  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0372  hypothetical protein  60 
 
 		 52 aa  64.7  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8076  hypothetical protein  59.26 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2788  hypothetical protein  57.41 
 
 		 55 aa  59.3  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4310  hypothetical protein  50 
 
 		 62 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0646462  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0767  hypothetical protein  48.15 
 
 		 93 aa  51.6  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2631  hypothetical protein  48.98 
 
 		 54 aa  50.8  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5552  hypothetical protein  38.89 
 
 		 56 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.423548  normal  0.0424308 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3834  hypothetical protein  48.94 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100486  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1213  hypothetical protein  46.94 
 
 		 55 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3522  hypothetical protein  46.94 
 
 		 55 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4969  hypothetical protein  30.91 
 
 		 54 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.689573 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5530  hypothetical protein  37.74 
 
 		 56 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.101899 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2499  hypothetical protein  38 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.421423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3068  hypothetical protein  45.76 
 
 		 55 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1538  hypothetical protein  46.94 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0327376 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3023  hypothetical protein  46 
 
 		 55 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0574  hypothetical protein  41.67 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0658365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4022  hypothetical protein  40.82 
 
 		 55 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654387  normal  0.0665825 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4582  hypothetical protein  42.86 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.890687  normal  0.353812 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>