13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4113 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4113  protein of unknown function DUF883, ElaB  100 
 
 		 123 aa  244  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3567  protein of unknown function DUF883, ElaB  94.31 
 
 		 123 aa  232  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2767  hypothetical protein  80.17 
 
 		 122 aa  200  5e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6997  hypothetical protein  57.72 
 
 		 123 aa  153  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6004  hypothetical protein  28.7 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1251  hypothetical protein  29.73 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.477256  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2939  hypothetical protein  25 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3634  protein of unknown function DUF883, ElaB  29.91 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.889919 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3969  vesicle-fusing ATPase  27.27 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1624  protein of unknown function DUF883 ElaB  28.97 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2105  hypothetical protein  28.97 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178666  normal  0.0591454 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0249  hypothetical protein  28.57 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0219  hypothetical protein  27.73 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.455194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>