13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3803 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007959  Nham_4133    95.92 
 
 
1102 bp  650    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4297  transposase, mutator type  96.43 
 
 
1131 bp  666    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.799563  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3803    100 
 
 
516 bp  1023    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.558068  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4295    97.98 
 
 
431 bp  180  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2845  hypothetical protein  95.52 
 
 
942 bp  109  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0049  transposase mutator type  87.5 
 
 
1269 bp  95.6  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1122  transposase mutator type  87.5 
 
 
1269 bp  95.6  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.370591  normal  0.143118 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6425  transposase mutator type  78.36 
 
 
1269 bp  91.7  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2616  transposase mutator type  77.56 
 
 
1269 bp  81.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.938771  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4126  hypothetical protein  100 
 
 
294 bp  79.8  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2796  transposase, mutator type  97.44 
 
 
1101 bp  69.9  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.520079  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4322  mutator family transposase  91.67 
 
 
1266 bp  48.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.70031  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0295  transposase  91.67 
 
 
1266 bp  48.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>