21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4133 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4133    100 
 
 		 1102 bp  2185    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4297  transposase, mutator type  99.69 
 
 		 1131 bp  1255    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.799563  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3803    95.92 
 
 		 516 bp  650    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.558068  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4135    98.62 
 
 		 510 bp  272  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2796  transposase, mutator type  97.58 
 
 		 1101 bp  222  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.520079  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4125    94.83 
 
 		 231 bp  182  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.976237  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1122  transposase mutator type  82.04 
 
 		 1269 bp  180  6e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.370591  normal  0.143118 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0049  transposase mutator type  82.04 
 
 		 1269 bp  180  6e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4124  hypothetical protein  93.44 
 
 		 537 bp  178  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693301  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1379  transposase, mutator type  100 
 
 		 1101 bp  176  9e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6425  transposase mutator type  80.36 
 
 		 1269 bp  141  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2616  transposase mutator type  78.81 
 
 		 1269 bp  137  7.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.938771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5554    83.12 
 
 		 1161 bp  103  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2518    82.44 
 
 		 1380 bp  77.8  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4028  hypothetical protein  92.16 
 
 		 396 bp  69.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3955  transposase, mutator type  88.46 
 
 		 1254 bp  56  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2799  transposase, mutator type  88.46 
 
 		 1254 bp  56  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3986  transposase, mutator type  88.46 
 
 		 681 bp  56  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4322  mutator family transposase  94.44 
 
 		 1266 bp  56  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.70031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0295  transposase  94.44 
 
 		 1266 bp  56  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0068    90.24 
 
 		 1235 bp  50.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>