20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2430 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2430  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  178  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.213345  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1707  hypothetical protein  84.27 
 
 		 89 aa  150  4e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123463  normal  0.276105 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3071  hypothetical protein  72.53 
 
 		 91 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0905739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3337  hypothetical protein  72.53 
 
 		 91 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3569  hypothetical protein  67.02 
 
 		 94 aa  120  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2383  hypothetical protein  68.48 
 
 		 91 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0573572  normal  0.991309 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4459  hypothetical protein  56.45 
 
 		 115 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218625  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3189  hypothetical protein  45.68 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.766246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3000  hypothetical protein  43.9 
 
 		 87 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.664026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2744  hypothetical protein  44.3 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.461077 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3225  hypothetical protein  44.44 
 
 		 87 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.571876 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2241  hypothetical protein  51.61 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1889  hypothetical protein  44.44 
 
 		 90 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.503768  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0374  hypothetical protein  41.11 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.403267 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1562  hypothetical protein  47.06 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3333  hypothetical protein  39.24 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0961  hypothetical protein  38.67 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.570752 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1931  hypothetical protein  43.55 
 
 		 83 aa  47.4  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.154345  hitchhiker  0.0000000596513 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0557  hypothetical protein  48.94 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2220  hypothetical protein  44.44 
 
 		 81 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.189609  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>