10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1993 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1993  helicase c2  100 
 
 		 701 aa  1441    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.214051  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1592  helicase c2  49.93 
 
 		 861 aa  683    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2436  DEAD-like helicase  25.59 
 
 		 834 aa  153  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3912  DEAD-like helicase  31.68 
 
 		 520 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4050  DEAD-like helicase  29 
 
 		 857 aa  124  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429268  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6719  helicase c2  24.2 
 
 		 840 aa  105  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1967  hypothetical protein  22.72 
 
 		 847 aa  103  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00196238  normal  0.91611 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0332  dead/deah box helicase domain-containing protein  20.57 
 
 		 845 aa  98.2  4e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.616588  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1147  DEAD-like helicases-like  25.07 
 
 		 859 aa  92  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1305  DEAD-like helicase  24.52 
 
 		 829 aa  92  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0305495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>