33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1966 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1966  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  172  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4297  transposase, mutator type  38.89 
 
 		 376 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.799563  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0438  putative transposase  74.19 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1277  transposase mutator type  62.07 
 
 		 424 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0407  transposase mutator type  62.07 
 
 		 424 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.994637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0882  transposase mutator type  62.07 
 
 		 424 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.031699  normal  0.346969 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0981  transposase mutator type  62.07 
 
 		 424 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1130  transposase mutator type  62.07 
 
 		 424 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513551 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1388  transposase mutator type  62.07 
 
 		 424 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1437  transposase mutator type  62.07 
 
 		 424 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1810  transposase mutator type  62.07 
 
 		 424 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.214084  hitchhiker  0.00000000849882 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2146  transposase, mutator type  33.73 
 
 		 415 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3201  transposase, mutator type  33.73 
 
 		 415 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0375462  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4028  hypothetical protein  51.35 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1631  transposase, mutator type  33.73 
 
 		 415 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6425  transposase mutator type  56.25 
 
 		 422 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1721  transposase, mutator type  51.61 
 
 		 417 aa  45.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2616  transposase mutator type  53.12 
 
 		 422 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.938771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0049  transposase mutator type  50 
 
 		 422 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1122  transposase mutator type  50 
 
 		 422 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.370591  normal  0.143118 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2717  transposase mutator type  54.84 
 
 		 424 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875305  hitchhiker  0.000051751 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3096  transposase mutator type  54.84 
 
 		 424 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0005  transposase mutator type  54.84 
 
 		 424 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0038  transposase mutator type  54.84 
 
 		 424 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0135  transposase mutator type  54.84 
 
 		 424 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0186  transposase mutator type  54.84 
 
 		 424 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.183961 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2156  transposase, mutator type  51.61 
 
 		 417 aa  42.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0191719  normal  0.0398782 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3976  transposase, mutator type  37.78 
 
 		 222 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.571911  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4322  mutator family transposase  48.57 
 
 		 421 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.70031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2799  transposase, mutator type  39.53 
 
 		 417 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3955  transposase, mutator type  39.53 
 
 		 417 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0295  transposase  48.57 
 
 		 421 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1330  ISAfe2, transposase  41.67 
 
 		 420 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.423267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>